El grupo de Bioinformática de la Universidad Complutense de Madrid (UCM) ha llevado a cabo tareas que han incluído el mantenimiento del servidor dedicado en exclusiva a los proyectos Consolider-AQUAGENOMICS y a la Red de Excelencia para la gestión de la información y de las bases de datos. También se han centrado en el mantenimiento y mejora del portal web que ha dado acceso único y centralizado a cada una de las distintas partes del proyecto. Han participado en la mejora del sistema de análisis de genomas ORF y DB y han trabajado en la curación, de acuerdo con el resto de los grupos, de las anotaciones funcionales para todos los genes. Además, han ayudado en el diseño y análisis de los resultados de los microarrays.
2012. Multi-Criteria Optimization of Regulation in Metabolic Networks. PLoS ONE 7: 1-10 e41122. Higuera C, Villaverde AF, Banga JR, Ross J, Moran F.
2013. iAnn: an event sharing platform for the life sciences. Bioinformatics 29(15): 1919-21. Jimenez RC, Albar JP, Bhak J, Blatter MC, Blicher T, Brazas MD, Brooksbank C, Budd A, De Las Rivas J, Dreyer J, van Driel MA, Dunn MJ, Fernandes PL, van Gelder CW, Hermjakob H, Ioannidis V, Judge DP, Kahlem P, Korpelainen E, Kraus HJ, Loveland J, Mayer C, McDowall J, Moran F, Mulder N, Nyronen T, Rother K, Salazar GA, Schneider R, Via A, Villaveces JM, Yu P, Schneider MV, Attwood TK, Corpas M.
2013. Modelling knowledge strategy for solving the DNA sequence annotation problem through CommonKADS methodology. Expert Systems with Applications 40: 3943–52. Xavier D, Morán F, Fuentes-Fernández R, Pajares G.
2013. Simulating a Model of Metabolic Closure. Biological Theory 8: 383-90. Cornish-Bowden A, Piedrafita G, Morán F, Cárdenas ML, Montero F.
2014. Modelling knowledge strategy for solving the DNA sequence annotation problem through CommonKADS methodology. Expert Systems with Applications 40(10): 3943–52. Xavier D, Morán F, Pajares G.
2012. Annotation pipeline for 454 assembly of sea bass gonads using model fishes and another databases. XI Spanish Symposium in Bioinformatics. Barcelona, 23-25 Enero.
2014. MASSA: Multi-Agent System to Support functional Annotation. In 12th International Conference on Practical Applications of Agents and Multi-Agent Systems, Salamanca, Spain. Xavier D, Crespo B, Gómez-Sanz R, Gómez-Sanz J.